Muzejní knihovna je od roku 2002 zapsána Ministerstvem kultury ČR do evidence knihoven
pod evidenčním číslem 3232/2002 jako základní knihovna se specializovaným knihovním
fondem. Knihovna je veřejně přístupná. Knihy jsou půjčovány pouze prezenčně do studovny,
návštěvníci studovny se musí řídit knihovním řádem.
Knihovna spravuje sbírku regionálních tisků, která obsahuje literaturu od počátku
19. století vztahující se tematicky k Ústí nad Labem a okolí. V současné době čítá
tato sbírka cca 6.500 výtisků knih, periodik, sborníků, výstavních katalogů, výročních
zpráv apod. Soustředěna je zde i sbírka beletrie od autorů, kteří svým životem nebo
svým dílem jsou našemu regionu blízcí.
Další částí knihovny je tzv. odborná knihovna, ve které je soustředěna základní
literatura k hlavním sbírkovým a zájmovým okruhům muzea. Zahrnuje, kromě všeobecných
encyklopedií a slovníků, knihy, časopisy a další materiály z oborů historie, archeologie,
přírodních věd (rozsáhlý je fond např. geologické literatury), umění, vlastivědy,
muzeologie bez ohledu na region. Celkem má knihovna cca 38 000 svazků, z toho téměř
polovina je v německém jazyce (zejména literatura vydaná před rokem 1945).
K vyhledávání knih slouží elektronický katalog.
Sbírku starých tisků tvoří 1500 svazků knih z období od 15. století do roku 1800.
Jedná se převážně o díla psaná v německém nebo latinském jazyce, sedmnáct titulů
je v češtině, padesát knih je rukopisných. Většina této právnické, teologické, vědecké,
ale i beletristické literatury pochází z 18. století, několik svazků bylo vytištěno
před rokem 1500.
Nejstarší knihu sbírky představuje Zrcadlo historie bratra Vincenta z kazatelského
řádu dominikánů z roku 1473. Nejstarší česky psanou knihou je Bible benátská vytištěná
v roce 1506 tiskařem Petrem Liechtensteinem v Benátkách.
Ve srovnání s jinými sbírkami starých tisků, které se dnes v muzeích nacházejí,
je ústecká sbírka asi střední velikosti. Protože většina svazků pochází z darů osob
a institucí s Ústeckem spojených svým životem nebo činností, mají kromě své historické,
umělecké a řemeslné hodnoty význam i jako zdroj informací o kulturním životě města
a regionu. Do roku 1661 je datována jedna z nejstarších regionálních publikací této
sbírky dílo císařského rychtáře v Ústí nad Labem, Christiana Friedricha Windische
von Aschenfeldt, který se věnoval genealogii rodu Salhausenů ze Svádova.
Sbírka starých tisků je součástí muzejních sbírek od založení muzea. Významným kurátorem
byl v letech 1965 až 1972 František Varcl, který sbírku odborně zpracoval. Současnou
kurátorkou je Helena Houfková.